Как выехать из России с просроченным загранпаспортом, если гражданство двойное?

Подскажите, пожалуйста, у меня такая ситуация. Постоянно проживаем в Германии, но у меня немецкий вид на жительство и российское гражданство. У сына 5 лет — двойное гражданство. Мы приехали к брату в Калининград на Новый год, на машине. На границе я обнаружила, что паспорт неделю как уже просрочен. Нас пустили, как россиян, но сказали, что бы мы оформили его в Калининграде.

Теперь я не знаю, как быть. Срок оформления от 1 до 3 месяцев, а так долго мы здесь находиться не можем. Как нам теперь выехать с просроченным паспортом?